Правильное ударение в словах "пандеми́я" и "эпиде́мия" закреплено в словарях. И, несмотря на то, что эти два слова греческого происхождения и так похожи между собой, ударение в них падает на разные слоги.В "Большом толковом словаре" под редакцией С. А. Кузнецова находим:
Эпидемия, -и; ж. [от греч. epidēmía — повальная болезнь] - широкое распространение какой-либо инфекционной болезни.
Пандемия, -и; ж. [от греч. pandemía — всеобщий, всенародный] - мед. эпидемия, охватывающая население целой области, значительной части страны или ряда стран.
Любопытно, что в некоторых словарях все же есть вариант "панде́мия", но он приводится с пометой "устаревшее".
Причины разного ударения в этих словах пока остаются неясными для лингвистов. Тем более, что в других языках (например, в английском) ударение падает на слог "дэ".
